项目来源

韩国国家科技基金

项目主持人

송지준

项目受资助机构

한국과학기술원

项目编号

未公开

立项年度

2023

立项时间

未公开

项目级别

国家级

研究期限

未知 / 未知

受资助金额

2500000.00韩元

学科

未公开

学科代码

未公开

基金类别

한국과학기술원연구운영비지원(주요사업비)

关键词

未公开

参与者

未公开

参与机构

未公开

项目标书摘要：연구내용
        기존에 발견하지 못했던 DM3의 필라멘트 형태를 처음으로 동정함으로써 식물 내에서의 DM3 작동 메커니즘 이해할 것이다.
        우선 DM3의 필라멘트 구조가 어떤 조건에서 잘 만들어지는지 확인하기 위해,negative stainingEM을 이용한 salt,pH screening을 진행하여 in vitro 상에서의 최적의 filament 생성 조건을 찾았다.이후 cryo-EM grid 조건을 찾기 위해,protein concentration,grid type,blotting force,그리고 blotting time 등을 조절하면서 한 micrograph에 충분한 양의 filament가 들어가도록 하였다.300 kV Titan Krios를 이용해서 14,658 장의 micrographs를 모을 수 있었고,Cryosparc,phenix와 같은 processing software를 이용해 3.2 Å의 atomic resolution 구조를 얻을 수 있었다.얻어진 electron map을 이용하여 coot와 isolde를 이용하여 model building을 수행하였고,그 결과 필라멘트 형성에 중요한 interface의 interaction을 확인 할 수 있었다.이렇게 발견한 필라멘트 형성에 중요한 잔기를 mutagenesis 실험으로 그 중요성을 확인하였고,싱가폴 국립대학교 최은영 교수님 연구실과의 협업을 통한 agroinfiltration 실험으로 해당 filament 구조가 식물 면역에 어떤 영향을 미치는지 알아보았다.
        연구결과는 atomic resolution으로 DM3 구조를 규명하였다.이는 DM3의 작용 메커니즘에 대한 새로운 가설을 제시하는데 큰 기여를 하였다.특히,DM3는 NLR 단백질인 DM2와 함께식물의 면역 반응을 유발하는 것으로 알려져 있다.이로 인해,DM3의 workingmechanism을 알게 된다면 식물의 NLR-triggered immune response 메커니즘을 더 깊게이해할 수 있을 것으로 기대된다.본 연구결과는 식물 면역 시스템에 대한 신규 인사이트를제공한다.